Le site archéologique d’Avdira, situé sur le cap Bouloustra, comprend les enceintes nord et sud, l'acropole de la ville antique et ses cimetières, qui s'étendent principalement vers le nord-ouest, le nord et le nord-est. Ces zones remontent aux périodes archaïque, classique et hellénistique. Dans l'enceinte nord, les visiteurs peuvent observer des vestiges de murs et de bâtiments à pièce unique appartenant à l'ancienne ville des Clazomènes d'Asie Mineure, datant du VIIe siècle av. J.-C. On y trouve également des sections des murs construits par les Téiens aux VIe et Ve siècles av. J.-C., un hangar à bateaux de la même époque, situé à l'extrémité nord-est du port avant que celui-ci ne soit bloqué par la sédimentation, ainsi que les ruines d'un sanctuaire dédié à Déméter et Coré, datant des VIe et IVe siècles av. J.-C., et d'un cimetière hellénistique. 

La partie la plus explorée et la plus accessible du site archéologique se trouve près du port moderne. Cette zone comprend la partie ouest de l'enceinte sud, où les visiteurs peuvent observer le mur ouest, une porte flanquée de tours, ainsi que des rues et des structures résidentielles. Avant d’entrer dans la ville antique, les visiteurs rencontrent d'abord des bâtiments de l'époque impériale romaine, qui ne respectent pas le système de quadrillage hippodamien. À proximité se trouvent la basilique funéraire du cimetière chrétien de Polystylos et les ruines d'un luxueux bain romain, remarquable par sa salle elliptique et son escalier menant à l'hypocauste. Les structures résidentielles visibles dans cette zone appartiennent également à la période impériale. 

Au-delà des principales sections accessibles, d'autres zones de fouilles sont disséminées sur l'ensemble du site, bien qu'aucune ne soit totalement achevée. À la limite sud du site se trouve l'acropole de l'ancienne ville, dont il ne reste que des parties des anciens murs. À l'extrémité ouest, près de la mer, le brise-lames du port occidental est visible, tandis que le second port, le port oriental, se trouve sur le côté nord-est de l'enceinte sud, avec son brise-lames et ses installations de stockage encore perceptibles. 

Si le plan de la ville ancienne est relativement bien préservé, notamment en ce qui concerne les résidences privées, les boutiques, les murs et les tombes byzantines de Polystylos, aucun bâtiment public n'a été identifié. La seule structure publique identifiée est le théâtre, situé entre les enceintes nord et sud, sur la pente d'une colline. Cependant, le théâtre est fortement endommagé et n'est pas accessible aux visiteurs. 

Des visites du site peuvent être organisées pendant les heures d’ouverture en semaine, sous réserve d’une réservation préalable.